Subversion 徹底消除了CVS 的以上弊端。無論批量提交包含多少文件修改，只有當全部文件修改都成功入庫，該提交才變得有效，才對其他用戶可見；否則，無論任何原因造成中斷，Subversion 都會自動執行“回滾”（rollback）操作。換一個說法，Subversion 保證所有的修改要么全部入庫生效，要么一個也不入庫，即對版本庫不作任何的修改。這是Subversion 的原子性提交（atomic commit）。
由于Subversion 的原子性提交特性和全局版本編號方式，當提交成功完成時，一個的、新的全局版本編號產生，而提交時用戶提供的日志信息與該新的版本編號關聯，只進行一次存儲（區別于CVS 的按文件重復存儲）。
五、支持變更集概念
由于Subversion 的所有提交是原子性的，每次成功提交形成的的全局版本號對應此次批量提交的所有文件修改，也是說，一個Subversion 版本號其實對應了一個邏輯上的變更集（change set），該變更集可能對應于對一個BUG 的修復，或者對應于對一個已有功能的改進，或者對應于一個新功能的實現。可以說，變更集是一個軟件開發活動的邏輯結果，該變更集可以通過其對應的版本號在軟件開發的其他過程中（如軟件合并/集成過程，軟件發布管理，變更管理系統，缺陷追蹤系統）被引用。因此，Subversion 將版本管理從單純的、單個的文件修改的層次通過邏輯上的抽象，上升到更便于理解和交流的開發活動的層次。
六、差異化的二進制文件處理
由于歷史原因，CVS 主要是為早期的程序員設計的，CVS 能夠有效處理文本文件（或ASCII文件，源代碼文件），可以對文本文件進行差異化的存儲、新舊版本的比較，文件合并等；但對于二進制文件，CVS 則明顯力不從心。在CVS 的版本庫中，對于二進制文件的歷史版本，CVS 能做的是對不同的版本進行獨立的、冗余的存儲，哪怕版本之間其實只存在微小的差異。舉例而言，一個10M 的二進制文件（照片、圖形文件、機械設計文件、電子設計文件）假如每周修改一次，無論每次修改的大小，一年下來，僅該文件要消耗500M 以上的存儲空間。而且，客戶端每次獲取該文件的新版本都要消耗10M 的網絡流量。
對于目前的開發團隊，無論是軟件開發，Web 站點的開發，手機等電子產品的研發，需要進行版本管理的不僅是源代碼等文本文件，還需要管理需求文檔、設計文檔、測試文檔、用戶手冊，圖形圖像文件，機械/電子設計文件等諸多的二進制文件，CVS 顯然不是一個好的選擇。
與CVS 不同，Subversion 采用統一的二進制差異算法（binary differencing algorithm），即對文本文件和二進制文件采用相同的差異比較算法，并以相同的方式在版本庫中進行存儲：每次提交后版本庫中只存儲相對于先前版本的差異，從而可以節省大量的存儲空間。
該二進制差異算法不僅應用在版本的存儲上，更為重要的是，Subversion 對二進制文件與文本文件一視同仁，當客戶端需要獲取新的版本時（如執行svn update），在網絡上只有版本的差異被傳輸，從而大大減少對網絡帶寬的消耗。更多細節參見“七、雙向的差異化－壓縮網絡傳輸”。
七、 雙向的差異化－壓縮網絡傳輸
如上所述，CVS 對二進制文件不能進行有效的差異化處理。對于文本文件，CVS 僅僅支持單向的差異化傳輸：從CVS 服務器到客戶端的傳輸是差異化的，即執行cvs update 時，只有差異的部分從服務器傳輸到客戶端；而當執行cvs commit 時，無論代碼變化多少，CVS 都需要從客戶端向服務器完整傳輸被修改文件的全部內容，不能只傳輸差異。
相反，無論是文本文件還是二進制文件，Subversion 都進行雙向的差異化傳輸，并且差異化內容還要進行壓縮/解壓縮的過程：在服務器端獲取差異顯而易見，與CVS 類似；Subversion 在客戶端獲取差異的秘密在于 — Subversion 在客戶端的工作拷貝中隱含了每個文件的一個“只讀的、干凈的”副本（該副本隱藏在隱含目錄.svn 里，通常不可見，該副本還有更多的妙用，參見“十二、更多的本地/離線操作”），通過比較用戶在客戶端的修改和該隱含的副本，Subversion 獲取需要真正傳送到服務器的差異，并對差異進行壓縮后才進行網絡傳輸。
對CVS 而言，操作的成本（網絡帶寬消耗是大的操作成本）與被修改的文件的大小成比例，而與修改本身的大小無關；對Subversion 而言，操作成本只與修改本身的大小成比例，而與被修改的文件的大小無關。因此，與CVS 相比，Subversion 消耗更少的網絡帶寬（以客戶端的存儲空間換取更少的帶寬消耗在目前的計算環境下應該是個相當不錯的選擇！）。Subversion 更加適合基于互聯網（或廣域網）進行協作開發的地理上分布的團隊 — 版本服務器集中、單一；客戶端廣泛分布。
八、高效、快捷創建分支和基線
CVS 和Subversion 都支持分支（branch）和基線（tag），通過分支與合并，可以有效支持大項目的并行開發模式；通過基線管理，可以準確標識一組文件的版本，有效進行軟件發布管理和必要時的歷史回溯。
但CVS 和Subversion 在實現分支和基線的方式上存在很大的不同。CVS 在創建分支的時候，需要對所有進行分支的文件進行依次的操作，因此分支的建立成本（主要是建立分支所需的時間，或消耗的計算資源）與參與分支的文件數量成比例，項目越大，版本庫越大，文件越多，分支的建立成本越高；基線（tag）的建立與此類似。
Subversion 的分支和基線是通過執行“拷貝”來建立的：回想一下在沒有引入版本管理工具的時候我們是如何進行所謂的“分支”和“基線”管理的？答案顯然是“拷貝” — 我們通過“拷貝”或“備份”來建立基線；同樣，為支持多個開發人員可以同時進行開發，我們為每個開發人員創建一份“拷貝”。由此看來，Subversion 通過“拷貝”來建立分支和基線顯得非常自然，有點“返樸歸真”的意思。
由于Subversion 的全局版本號特性，Subversion 中分支或基線的創建過程，或Subversion中的“拷貝”過程，真正的操作是在版本庫中創建一個到某一全局版本號的指針（pointer），不再需要針對眾多的單個文件依次執行操作。因此，該操作的成本為一個很小的常數，與項目大小，版本庫大小，文件數目的多少無關；并且，分支或基線的建立不需要進行版本的冗余存儲，新建立的分支或基線基本不占用版本庫空間，分支的后續存儲空間的開銷也只與修改的大小有關。
九、集成Apache Web Server，提供更多的特性
Subversion 通過與Apache Web Server 的集成，可以提供基于http/https 協議的版本庫訪問機制，從而支持Subversion 跨越防火墻的安全訪問。除此以外，Subversion 還可以利用更多的Apache 特性，包括但不限于：Apache 豐富的用戶認證機制（包括通過LDAP服務器如Windows Active Directory 服務器的用戶認證），基于目錄路徑的精細粒度的訪問控制，對傳輸的網絡流量進行壓縮/解壓縮，瀏覽版本庫目錄結構等等。
